Апокалипсис хочет покорить мир. Профессор X пробует общаться с ним в Египте но, вместе с Шторм, исчезает так же, как ранее исчез Магнето. Апокалипсис обратил Магнето, Профессора Икс, Шторм и Мистик в своих Четырех Всадников и покрыл мир сетью пирамид энергии, которые превратят всех людей с бездействующим Геном Икс в мутантов и уничтожат тех, кого превратить не удастся. SHIELD использует Стражей, чтобы напасть на Апокалипсиса и пирамиды. Апокалипсис освобождает своих Четырех Всадников, чтобы защитить пирамиды и Сфинкс. Люди Икс, Новые Мутанты, Братство, Аколиты и другие сражаются против всадников, в то время как Апокалипсис готовится преобразовать человечество в мутантов. Шельма использует силу Пиявки в попытке остановить Апокалипсис прежде, чем его планы будут выполнены. В конце концов Роуг и Логан опять закрывают его в гробнице. Профессор, пока был под контролем Апокалипсиса видел будущее: как Магнето станет их другом, как Коллос и Гамбит присоединятся к Людям Икс, как Джин Грей станет их злейшим врагом…

Во время тренировок Химера чуть не погибает, ее спасает Даниэлла Мунстар и они сразу становятся друзьями. Дэни Мунстар переехала в институт после спасения Китти, но ее присутствие вызывает кошмары и «сны на яву» у других. Профессор намеревается решить эту проблему… Внезапно, Кити просыпается и понимает, что все это, по–видимому, ей приснилось. Оказывается, что никто больше не помнит, что Дэни была в институте. Однако Химере постоянно мерещится, что Даниэлла в опасности и просит о помощи. Она уговаривает Курта помочь найти Дэни. Вместе они узнают, что случилось на самом деле и что Даниэлла Мунстар не только часть сна…

Руж никак не может простить Мистик и решает уехать подальше от всего, что про нее напоминает. Но ей это не удается — Гамбит похищает Шельму, чтобы хитростью воспользоваться ее силами и заставить помочь спасти его приемного отца. Руж узнает про то, что ее опять хотят использовать, но все–таки помогает.

Спайк возвращается, превратившись в сердитого мстителя, который защищает Морлоков. Он не побоялся появится на публике с его мутацией, вызывая панику в обществе. Тем более, что мир находится под чрезвычайным предубеждением против мутантов. Антимутантские расисты, Данкан Меттьюс и его друзья охотятся на Спайка и наталкиваются на мутанта, по имени Пиявка. Когда Люди Икс борются с бригадой Данкана (и пробуют помешать Эвану вызвать большие разрушения), Пиявка останавливает сражение своей силой. Спайк понимает, что его гнев разрушил возможность Пиявки жить нормальной жизнью. В это время SHIELD выпускают Боливара Траска, чтобы он строил новых Стражей для сражения с Апокалипсисом.

Чарльз Ксавье обнаружил, что у него есть сын Дэвид, и, что его было похищено. Люди Икс находят сына Ксавье, но оказывается, что он не только один из самых сильных мутантов, но и, что он страдает от многочисленных расстройств личности, превращаясь в того человека, чья личность доминирует в данный момент. Обхитрив Ксавье, Лукас — злая личность, уничтожает все другие и сбегает.

Логана похитила HYDRA и использовала как приманку для Х–23, зная что она придет к нему на помощь. Им удалось захватить и ее и Росомаху, но не удалось удержать: они освободились и Х–23 уничтожила главную базу HYDRA, а также ее руководительницу Вайпер.

Братство нашло новый способ зарабатывать деньги — они стали супергероями Бейвиля и всегда появлялись на месте проишествия, которые они и подстраивали. Пользуясь репутацией героев и силой Ванды они засадили нескольких людей Икс в тюрьму, однако, ненадолго. Подстроив столкновение поездов Братство поняли что с этим им не справится и поспешили убежать. С помошью Людей Икс и Ланса (который с самого начала был против) катастрофу удалось предотвратить.

Странные явления происходят в результате пробуждения Апокалипсиса. Скрытая в джунглях пирамида майя активируется Апокалипсисом и становится его базой. Вокруг пирамиды появилось абсолютно непробиваемое и непроходимое защитное поле. Между тем Курт, который желает оживить мать договаривается с Вандой, чтоб она устроила встречу с Агатой Харкнесс.